Đây là nhiệm vụ trong tâm tỉnh đang tập trung lãnh đạo, chỉ đạo công tác này. Đến nay toàn tỉnh đã rà soát, xác định và tổ chức quy hoạch 69 khu với 216 điểm có khả năng tiếp nhận được 13.093 hộ. Trong đó phương án chọn 64 khu, 204 điểm có khả năng tiếp nhận 12.615 hộ (năm 2006 phê duyệt được 6 khu, 39 điểm có khả năng tiếp nhận 3.026 hộ); đang triển khai thi công 157 dự án thành phần tại các khu, điểm tái định cư.Từ năm 2004 đến nay đã di chuyển được 4.578 hộ, trong đó di chuyển nội xã, nội huyện 3.506 hộ, di chuyển ra ngoài huyện 1.072 hộ.Trong năn 2007 tỉnh sẽ phải tổ chức di chuyển 5.590 hộ.
Thực hiện quyết định số 459/QĐ-TTg ngày 12/5/2004 của Thủ tướng Chính phủ và Quyết định số 02/2007/QĐ-UBND ngày 09/01/2007 của UBND tỉnh về việc ban hành quy định về bồi thường di dân tái định cư Dự án thuỷ điện Sơn La và quy định của Luật Đất đai, Nghị định 181, Nghị định 197 và gần đây nhất là Nghị định số: 84/2007/NĐ-CP Quy định bổ sung về việc cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, thu hồi đất, thực hiện quyền sử dụng đất, trình tự, thủ tục bồi thường, hỗ trợ, tái định cư khi Nhà nước thu hồi đất và giải quyết khiếu nại về đất đai. Tỉnh đã tiến hành thu hồi tổng thể đất vùng ngập với tổng diện tích là 15.700ha, tiến hành thu hồi đất, giao đất tại các điểm tái định cư đảm bảo việc giao đất ở là 400m2/hộ và 2500m2 đất sản xuẩt/khẩu cho các hộ tái định cư. Nhìn chung các hộ di dân tái định cư đang từng bước ổn định đời sống và sản xuất tại nơi ở mới.